Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ttc8Q8VD72 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ttc8Q8VD72 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc8Q8VD72 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms