Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc18Q8VD24 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms