Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxc12Q8K5B8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms