Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Vmn1r72Q8K3N7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms