Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssh3Q8K330 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Ssh3Q8K330 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssh3Q8K330 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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