Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms