Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Csnka2ipQ8CH19 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Csnka2ipQ8CH19 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnka2ipQ8CH19 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnka2ipQ8CH19 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Csnka2ipQ8CH19 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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