Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Ercc8Q8CFD5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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