Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rnf170Q8CBG9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms