Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ccdc113Q8C5T8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms