Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Amigo3Q8C2S7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Amigo3Q8C2S7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms