Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp37Q8C0R0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms