Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg16l1Q8C0J2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg16l1Q8C0J2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg16l1Q8C0J2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg16l1Q8C0J2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg16l1Q8C0J2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg16l1Q8C0J2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg16l1Q8C0J2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg16l1Q8C0J2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms