Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ap3s2Q8BSZ2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms