Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q8BGC1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q8BGC1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms