Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms