Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Zbed4Q80WQ9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zbed4Q80WQ9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms