Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pcsk9Q80W65 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms