Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc88cQ6VGS5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Ccdc88cQ6VGS5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccdc88cQ6VGS5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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