Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Atg16l2Q6KAU8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms