Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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CltbQ6IRU5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CltbQ6IRU5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CltbQ6IRU5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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CltbQ6IRU5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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CltbQ6IRU5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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CltbQ6IRU5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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CltbQ6IRU5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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CltbQ6IRU5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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CltbQ6IRU5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms