Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt39Q6IFX4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt39Q6IFX4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms