Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sbno1Q689Z5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Sbno1Q689Z5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sbno1Q689Z5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms