Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Trim24Q64127 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms