Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PcolceQ61398 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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PcolceQ61398 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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PcolceQ61398 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PcolceQ61398 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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