Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BcanQ61361 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms