Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cln3Q61124 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cln3Q61124 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Cln3Q61124 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cln3Q61124 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cln3Q61124 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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