Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprnQ60673 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms