Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Slc5a6Q5U4D8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms