Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cdv3Q4VAA2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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