Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms