Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6899Q3USS0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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