Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms