Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms