Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms