Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q3U6N9 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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