Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hectd3Q3U487 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms