Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ulk3Q3U3Q1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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