Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc9Q3U0M1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms