Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srsf6Q3TWW8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Srsf6Q3TWW8 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms