Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Samd11Q1RNF8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Samd11Q1RNF8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Samd11Q1RNF8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Samd11Q1RNF8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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