Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Perm1Q149B8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Perm1Q149B8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Perm1Q149B8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Perm1Q149B8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Perm1Q149B8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Perm1Q149B8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Perm1Q149B8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Perm1Q149B8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Perm1Q149B8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms