Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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