Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cntnap5bQ0V8T8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.3 ms