Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gdf3Q07104 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms