Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp2Q06649 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms