Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GscQ02591 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GscQ02591 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GscQ02591 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GscQ02591 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GscQ02591 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
GscQ02591 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
GscQ02591 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
GscQ02591 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms