Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VcpQ01853 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.9 ms