Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23aQ01405 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms