Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
PrcdQ00LT2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms